편의점 직원의 상습 절도 문제와 대처 방안

제가 경영하는 편의점에 수십차례 1만원 정도씩 소량 꾸러미를 싸서 물건을 가지고 상습적으로 나가는 직원이 있습니다. 최근에 수상히 여기고 조사를 하기 시작해서 CCTV 남아 있는 7월 중순부터 기록을 자세히 뒤져 보았습니다. 50% 정도 다수 꾸러미를 챙겨서 가지고 나가는 화면들을 저장해 놓았습니다. 그런데 문제는 이 몇몇 CCTV 증거는 해봐야 10만원에서 20만원 정도의 금액밖에 되지 않습니다. 그 직원이 9개월 동안 근무하였기 때문에 재고 조사를 했을 때 평상시보다 세 배가 많은 약 300만원 이상의 물건이 없어진 것을 알았습니다만 씨씨티비 증거로는 소액밖에 되지 않는다는 점이 문제입니다. 그런 점을 알고 이 근로자가 해 볼라면 해보라는 식으로 역으로 저에게 수당 및 기타 협박을 합니다. 상습 절도로 고소를 하고 피해 금액을 특정할 수 없지만 300만원 이상으로 고소를 할 수 있을까요?